جواد موگویی نوشت: در این ۱۴ سال ۶ دانشمند ترور شدند؛ بعلاوی انفجارهای نطنز و پارچین و سرقت اسناد هسته‌ای. اما سیستم اطلاعاتی درحالی مدام از اشراف سخن می‌گوید که در این سال‌ها هیچ پاسخی درباره عوامل این شبکه نداده است! اگر سیستم اطلاعاتی رویه خود را تغییر ندهد، موساد دانشمندی را در تهران زنده نخواهد گذاشت.
وزیر خارجه روسیه با بیان اینکه از مواضع کشورهایی که می خواهند علاوه بر مساله هسته ای مسائل دیگر را در برجام مطرح کنند حمایت نمی کنیم، تاکید کرد: «اعتماد به کشورهای غربی مجاز نیست و نباید به آنها باور کرد.»
محسن رضایی گفت: «در ترور شهید فخری زاده از سلاحی استفاده شده که به «ناتو» تعلق دارد».
رحیم پور ازغدی در مورد شهید فخری زاده نوشت: «همکارانش گفتند گر چه دو نخست‌وزیر رذل صهیونیست علنا نام دکتر فخری‌زاده را به عنوان هدف اعلام کرده بودند و آمریکایی‌ها و کارگزارانشان تشنه به خون او بودند در داخل کشور نیز تحت فشار و ایذا بود. به نام برجام دستهایش را بستند و با دست بسته، هدف مسلسل تروریزم دولتی غرب قرار گرفت و مخالفان داخلی پروژه او نه حاضر به مناظره بودند و نه مسئولیت تصمیمهای خود را می‌پذیرند.»
جانشین فرمانده کل سپاه پاسداران جزییات دقیق عملیات ترور شهید فخری زاده را فاش کرد و طبق گفته سردار فدوی تروریستی در صحنه حادثه نبوده و در این عملیات از هوش مصنوعی استفاده شده بود.
سردار رمضان شریف سخنگوی سپاه با بیان اینکه ترور یک دانشمند در خیابان آن هم با دستگاه ماهواره‌ای نمی‌تواند امنیت ما را خدشه‌دار کند، تاکید کرد: «در عین حال اگر در جایی اشراف اطلاعاتی ما مشکل دارد، باید آن را جبران کنیم.»
ناصر هادیان، تحلیلگر مسائل استراتژیک می گوید: جو بایدن یک فرصت است و ما نباید از این فرصت فقط برای حل و فصل برجام استفاده کنیم. می‌توان گفت که حضور جو بایدن در کاخ سفید می‌تواند مقداری به نفع ما در منطقه هم باشد. سیاست‌های امریکا در منطقه احتمالا تا حدودی به نفع ما متعادل خواهد شد. ما باید در چند ماه آتی منتظر شنیدن این واژه از زبان بایدن باشیم: «منطقه خاورمیانه باید مشکلات خودش را خودش حل کند.» بایدن با این سیاست به همه از اسراییل تا عربستان و امارات و ما سیگنال می‌دهد که دولت دونالد ترامپ تمام شده است.
روزنامه کیهان می نویسد: اقدام قدرتمندانه ایران در واکنش به ترور شهید دکتر فخری‌زاده و بقیه اقدامات جنایتکارانه‌ای که در ده سال اخیر از سوی رژیم صهیونیستی علیه جمهوری اسلامی صورت گرفته است، می‌تواند وضعیت کنونی منطقه را به ضرر آمریکا، رژیم صهیونیستی و وابستگان عرب این دو تغییر دهد.
روزنامه کیهان در شماره امروز خود نوشت: «آدمخواران شیک‌پوشی که کشتار مردم عادی را «تلفات جانبی» می‌نامند و علناً می‌گویند ترور دانشمند ایرانی برای مذاکره مفید است! آدمخوارها وقتی دعوت به مذاکره می‌کنند، آنچه چیده‌اند میز شام است. بشقاب‌ها را چیده‌اند و چاقو و چنگال‌ها را تیز کرده‌اند. کمدی مذاکره آدم و آدمخوار با فقدان دردناک برای یک سو و دهان باز و خون‌آلود و سیری‌ناپذیر سوی دیگر میز همراه است. مفلوک جماعتی که از این میز انتظار گشایش دارند.»
علم الهدی امام جمعه مشهد گفت: مگر همین آقای جو بایدن در دولت اوباما نگفت ما باید خانه امن ایران را از بین ببریم؟ امنیت را از بین ببریم، در مقام برهم زدن خانه امن ایران، هنوز روی کار نیامده، این اولین قدمشان بود که امنیت اندیشمندان و دانشمندان ما و امنیت افکار برجسته ما را گرفتند.